与猪传染性胃肠炎病毒有关的重组犬冠状病毒在犬群中传播（CCOV-IIb的发现）

文章标题：重组犬冠状病毒与猪传染性胃肠炎病毒的关系与传播研究发现，急性胃肠碧大炎死亡幼犬的肠道和内脏中分离出4株犬冠状病毒II型（CCoV-II）。这些CCoV-II毒山慧饥株的S蛋白N-末端区域与猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）具有极高亲缘关系，而基因组其他部分与近期分离的CCoV-II毒株关系密切。实验感染发现，TGEV-like CCoV可引起轻度胃肠炎而不涉及全身。病毒中和试验显示，参考毒株与TGEV-like CCoV的抗原性存在差异，支持了TGEV-like CCoV潜在重组起源的观点。冠状病毒在广泛物种中引发多种疾病，根据抗原性和遗传关系分为三类，感染犬的冠状病毒分别属于第一类和第二类。CCoV-II具有不寻常的毒力，包括引起幼犬全身疾病的变异株。此外，报道了CCoV-II、CCoV-I或猪传染性胃肠炎病毒之间的重组病毒。本文报告了四株CCoV-II的基因组、生物学和抗原性特征，S蛋白N-末端结构域与经典CCoV株高度不同，但与TGEV关系密切。研究发现四只死于胃肠炎的狗体内存在CCoV-II型病毒，包括大丹犬、吉娃娃犬、混血狗和马耳他小狗。所有狗的内脏也检测到CCoV-II型RNA。除了ORF3b、ORF3c和ORF7b外，所有预测基因前都有重复逗返的基因间序列CTAAAC。S蛋白长度为1457个氨基酸，与经典II型CCoV和FCoV的S蛋白长度相似。S蛋白的氨基酸序列同源性在95.1%至98.9%之间，与其他II型冠状病毒的同源性仅为79.9%至82.8%。分析发现，这些病毒与TGEV遗传关系更高，而与其他1a组冠状病毒关系较低，特别是在N端部分。系统发育分析显示，1a群冠状病毒聚为两个主要分支，包括CCoV/FCoV-I和猪CoV及CCoV/FCoV-II。这四个TGEV-like CCOV在TGEV和PRCOV的同一簇内形成一个单系群，与其他II型冠状病毒分开。这种分离模式在N端更为明显。非结构蛋白分析表明，TGEV like-CCOV与典型CCoV-II毒株之间存在恒定的分离。通过引物扩增重叠片段，测定了341/05株和174/06株（登录号EU856361~EU856362）ORF1a的部分核苷酸序列和ORF1b的全序列。分析证实，与CCoV-II CB/05株的序列一致性极高。与TGEV、FCoV-II和FCoV-I的相似性较低。基因组序列分析显示，与CCoV-II-CB/05有较高的遗传亲缘关系。Simplot分析显示，TGEV-like CCoV的潜在重组起源明显。在不同时期和不同地理区域检测到这些病毒，推测TGEV样冠状病毒在犬类中有效传播。实验感染没有导致全身感染或病毒通过血液传播。在自然感染的狗的内脏中检测到类似TGEV的冠状病毒。参考和重组CCoV之间的抗原差异可能对预防有重要意义。经典病毒和重组病毒在基因和抗原上的差异促使将CCoV-II进一步划分为两个不同的亚型，即CCoV-IIa和CCoV-IIb，分别包括参考分离株和类似TGEV的CCoV-II分离株。